MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	GAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013203	TTG	2	6	65	70	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013203	AT	3	6	95	100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013203	CTA	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013203	TTG	2	6	170	175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013203	TCAT	2	8	183	190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013203	GAAA	2	8	194	201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013203	TTC	2	6	212	217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013203	TTG	2	6	231	236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013203	AGG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013203	ATT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013203	TGT	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013203	AG	3	6	2796	2801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013203	TCT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013203	TTA	3	9	2908	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013203	T	6	6	2925	2930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013203	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013203	GTC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013203	AG	3	6	5845	5850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013203	AAC	2	6	7867	7872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013203	TA	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013203	T	6	6	10749	10754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013203	A	7	7	11412	11418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013203	TAT	2	6	11445	11450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013203	CAC	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013203	ATT	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013203	CCA	2	6	11699	11704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013203	A	6	6	11752	11757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013203	AAT	2	6	11799	11804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013203	GA	3	6	11874	11879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013203	TCT	2	6	16004	16009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013203	T	6	6	16013	16018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013203	TCA	2	6	17115	17120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013203	TCT	2	6	17152	17157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013203	A	6	6	17161	17166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013203	ACGT	2	8	17197	17204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013203	ACTT	2	8	17245	17252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013203	CGT	2	6	17275	17280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013203	CGT	2	6	17354	17359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013203	CGC	2	6	17431	17436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013203	GTT	2	6	17441	17446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013203	CGA	2	6	17476	17481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013203	GCTG	2	8	17578	17585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013203	GC	3	6	17594	17599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013203	TAA	2	6	17603	17608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013203	GAA	2	6	17615	17620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013203	GAG	2	6	17623	17628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013203	CTT	2	6	17683	17688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013203	TCT	2	6	17744	17749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013203	CAG	2	6	17774	17779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013203	TGGC	2	8	17837	17844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013203	GAT	3	9	17850	17858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013203	TGC	2	6	17868	17873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013203	TCCTGT	2	12	17946	17957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013203	CTT	2	6	17982	17987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013203	TGC	2	6	18009	18014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013203	CAT	2	6	18069	18074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013203	ATT	2	6	18085	18090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013203	GGT	2	6	18196	18201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013203	GGC	2	6	18253	18258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013203	TAA	2	6	18264	18269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013203	TCC	2	6	18351	18356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013203	GCA	2	6	18389	18394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013203	CA	3	6	18494	18499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013203	TGC	2	6	18543	18548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013203	CGG	2	6	18579	18584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013203	TTG	2	6	18590	18595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013203	ATA	2	6	18608	18613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013203	ACA	2	6	18695	18700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013203	AC	3	6	18705	18710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013203	GT	4	8	20115	20122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013203	GA	3	6	20833	20838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013203	TCG	2	6	22689	22694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013203	GTTTT	2	10	22750	22759	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013203	TAAA	2	8	22770	22777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013203	CCT	2	6	23581	23586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013203	TTA	2	6	23604	23609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013203	TAC	2	6	23619	23624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013203	GCG	2	6	23856	23861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013203	CTC	3	9	23909	23917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013203	TGATT	2	10	23933	23942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013203	TGC	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013203	AT	3	6	23960	23965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013203	TGT	2	6	23971	23976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013203	TA	3	6	23980	23985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013203	T	6	6	24015	24020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013203	CAT	2	6	25482	25487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013203	TG	3	6	25494	25499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013203	T	8	8	25507	25514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013203	ATG	2	6	25683	25688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013203	AGG	2	6	25746	25751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013203	ATT	2	6	26075	26080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013203	CAG	2	6	26566	26571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013203	GTT	2	6	26576	26581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013203	TCA	2	6	27984	27989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013203	ATGC	2	8	28531	28538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013203	T	6	6	28560	28565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013203	AG	3	6	28615	28620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013203	GAATG	2	10	28637	28646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013203	ACC	2	6	28656	28661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013203	GGT	2	6	28684	28689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013203	T	7	7	28717	28723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013203	ATTTG	2	10	28788	28797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013203	TAC	2	6	28829	28834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013203	A	6	6	28841	28846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013203	A	7	7	28850	28856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013203	T	6	6	28931	28936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013203	T	7	7	28966	28972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013203	ACT	2	6	28982	28987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013203	ATTC	2	8	28994	29001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013203	A	6	6	29004	29009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013203	TTGA	2	8	36785	36792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013203	AGC	2	6	36832	36837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013203	GA	3	6	36901	36906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013203	A	6	6	37884	37889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013203	AGT	2	6	37914	37919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013203	AAT	2	6	37947	37952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013203	CTT	2	6	39444	39449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013203	CTT	2	6	39455	39460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013203	AG	3	6	39630	39635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013203	TAT	2	6	40584	40589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013203	AGGC	2	8	40590	40597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013203	AGA	2	6	40598	40603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013203	A	6	6	40636	40641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013203	T	6	6	40676	40681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013203	GA	3	6	40725	40730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013203	CAA	2	6	45110	45115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013203	GAA	2	6	45182	45187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013203	CGG	2	6	45534	45539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013203	AGA	2	6	45639	45644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013203	AAG	2	6	45649	45654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013203	AT	3	6	46269	46274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013203	AT	3	6	46308	46313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013203	GAT	2	6	46385	46390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013203	CTG	2	6	46406	46411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013203	CA	3	6	47364	47369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013203	TGGG	2	8	47487	47494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013203	TTA	2	6	47651	47656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013203	AG	3	6	47676	47681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013203	ATTATC	2	12	47688	47699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_013203	TGTA	2	8	47741	47748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013203	GTTT	2	8	50080	50087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013203	TTAA	2	8	50140	50147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013203	GTT	3	9	50192	50200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013203	CCT	3	9	50476	50484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_013203	GAG	3	9	50501	50509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013203	ATG	2	6	50510	50515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013203	AAG	2	6	50600	50605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013203	TTC	2	6	51781	51786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013203	A	7	7	52817	52823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013203	ATAA	2	8	52885	52892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013203	TGA	2	6	53544	53549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013203	TAA	2	6	53569	53574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013203	GCT	2	6	54352	54357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013203	AATTT	2	10	54359	54368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013203	GT	3	6	54413	54418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013203	ATG	2	6	54426	54431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013203	AT	3	6	54451	54456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013203	ATT	2	6	54474	54479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_013203	T	6	6	55042	55047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013203	TA	3	6	55074	55079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013203	CTTT	2	8	55127	55134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_013203	CAT	2	6	55136	55141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013203	ATG	2	6	55143	55148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013203	TTC	2	6	55162	55167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013203	TTC	2	6	55209	55214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013203	A	7	7	55225	55231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_013203	T	6	6	55327	55332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013203	CAG	2	6	55333	55338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_013203	TTC	2	6	55340	55345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_013203	TCTT	2	8	55439	55446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_013203	TAG	2	6	55536	55541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013203	CG	3	6	58029	58034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_013203	TGC	2	6	58035	58040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_013203	ACC	2	6	58402	58407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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189	NC_013203	AAT	2	6	58478	58483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_013203	T	6	6	95870	95875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_013203	GAAT	2	8	96119	96126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013203	TA	3	6	96132	96137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_013203	AC	3	6	96174	96179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_013203	TA	3	6	96395	96400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_013203	TA	3	6	96413	96418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_013203	AGC	2	6	96523	96528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_013203	AAATT	2	10	96550	96559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_013203	TGT	2	6	96587	96592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_013203	GTT	2	6	100596	100601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_013203	TGA	2	6	100620	100625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_013203	CTA	2	6	102812	102817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_013203	T	7	7	107363	107369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_013203	TCT	2	6	107405	107410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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319	NC_013203	TA	3	6	108363	108368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_013203	AGG	2	6	108414	108419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_013203	GTT	2	6	111295	111300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_013203	TGA	2	6	111426	111431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_013203	TG	3	6	111549	111554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_013203	TTGG	2	8	117046	117053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
332	NC_013203	A	6	6	117056	117061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_013203	GGA	2	6	129454	129459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_013203	CTT	2	6	162998	163003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_013203	CTC	2	6	163008	163013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_013203	AGG	2	6	163033	163038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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